根据我国相关法律法规，拆迁补偿协议一般由法定代表人签署。不仅法定代表人可以签字，而且法定代表人可以委托他人代为签字。但企业拆迁前，拆迁部门应当与企业签订拆迁补偿协议。企业属于法人组织，协议由法定代表人签署。                     
《国有土地上房屋征收与补偿条例》 第八条 为了保障国家安全、促进国民经济和社会发展等公共利益的需要，有下列情形之一，确需要征收房屋的，由市、县级人民政府作出房屋征收决定：   （一）国防和外交的需要；   （二）由政府组织实施的能源、交通、水利等基础设施建设的需要；   （三）由政府组织实施的科技、教育、文化、卫生、体育、环境和资源保护、防灾减灾、文物保护、社会福利、市政公用等公共事业的需要；   （四）由政府组织实施的保障性安居工程建设的需要；   （五）由政府依照城乡规划法有关规定组织实施的对危房集中、基础设施落后等地段进行旧城区改建的需要；   （六）法律、行政法规规定的其他公共利益的需要。